Data Science/Bioinformatics with Biopython

2. Chapter1. Introduction to BioPython

HJChung 2020. 3. 8. 15:28

제 1장. 바이오파이썬 소개 

 

바이오파이썬이란 생물정보학 프로그래밍을 위한 파이썬 라이브러리입니다. 

바이오파이썬으로 할 수 있는 일들에는 

  1. 생물정보학에서 자주 사용하는 파일 포맷에서 필요한 부분을 가져오는 파싱 작업을 할 수 있습니다. 
    ex) FASTA파일 파싱
  2. 유전체 서열정보를 문자열 수준에서 다룰 수 있습니다. 즉, 위의 작업으로 가져온 서열 데이터를 파이썬의 문자열을 다루듯 쉽게 처리할 수 있습니다. 
    ex) PubMed 검색
  3. 웹 정보를 가져와 다량의 정보를 쉽게 자동화해 처리할 수 있습니다. 
    ex) GenBank 검색
  4. 생물정보학에서 사용하는 툴을 사용하여 여러 작업을 진행할 수 있습니다. 
    ex) BLAST를 사용하여 서열 찾기

이번 장에서는 바이오파이썬에 대해 간단히 알 수 있는 장이었습니다.